La Base di Caprera è situata nella zona sud-occidentale dell'isola entro il Parco nazionale marino e terrestre dell'Arcipelago de La Maddalena. L'isola con le sue coste frastagliate, le acque limpide e la profumata vegetazione mediterranea offre uno scenario naturale suggestivo, nonché le migliori condizioni di vento e di mare per veleggiare, essendo situata tra la Sardegna e la Corsica e protesa verso le Bocche di Bonifacio.
Presso la base di Caprera si svolgono i corsi settimanali e quindicinali.